AB SCIEX TripleTOF 6600四極桿飛行時間質譜儀：蛋白質組學研究的革新平臺

AB SCIEX TripleTOF 6600是一款高性能的四極桿-飛行時間（Q-TOF）液質聯用系統，代表了當前蛋白質組學和代謝組學研究的技術。該系統結合了高分辨率、高質量精度和快速掃描速度等優勢，特別配備了創新的SWATH 2.0數據非依賴采集技術，為大規模生物標志物發現和系統生物學研究提供解決方案。

一、核心技術特點

TripleTOF 6600采用三重四極桿-飛行時間串聯設計，具有質量分析能力。其四極桿質量范圍為5-2250 amu，飛行時間質量范圍擴展至5-40,000 amu，可覆蓋從小分子代謝物到大分子蛋白質的廣泛分析需求。系統采用高頻高場飛行管設計，配備15KV加速電壓和40GHz檢測器頻率，在全掃描速度下分辨率可達≥50,000 FWHM（m/z 956），質量精度<2.0 ppm（外標法），確保了數據的超高準確性和可靠性。

SWATH 2.0采集技術是該系統的核心創新，采用數據非依賴采集(DIA)模式，通過可變窗口（2-25Da）將質譜全范圍劃分為多個連續區間進行全掃描和MS/MS采集。這種方法可實現單次分析定量數千種蛋白質，數據完整性媲美傳統的MRM"黃金標準"，而分析能力提高了30倍，研究時間減少90%。瑞士聯邦理工學院Ruedi Aebersold博士評價道："SWATH技術在大規模定量分析流程中具有價值，可提供更為精確和完整的生物學信息"。

二、儀器性能優勢

TripleTOF 6600在靈敏度和通量方面表現突出：

• 掃描速度：高達200Hz，支持100張MS譜/秒的采集速率，1秒內可完成正負離子模式切換

• 動態范圍：跨越5個數量級，線性范圍>10?，可同時檢測高豐度和極低豐度化合物

• 靈敏度：ESI MS/MS正離子模式下，1pg柱上樣品的信噪比>40,000:1（m/z 609.2807）

• 離子源配置：支持Turbo V離子源和SelexION+差分離子淌度技術，顯著提升復雜基質分析的準確性

系統優化了穩定性，QJet離子導向系統減少污染風險，連續運行72小時RSD<3%，滿足高通量需求。創新的全子離子采集定量功能可在軟件中設置質量數范圍可變窗口，1秒內將1-2250Da分離為100個區間并進行二級碎裂采集，通過特定算法歸類碎片離子，實現高分辨全景數據定量。

三、應用領域與工作流程

TripleTOF 6600廣泛應用于多個研究領域：

1. 蛋白質組學：實現"一針分析"定量數千種蛋白質，支持從發現到驗證的全流程研究

2. 代謝組學與脂質組學：對細胞或組織水平的親水性代謝物進行全面分析，鑒定生物標志物和代謝通路

3. 生物制藥：單克隆抗體表征、宿主細胞蛋白檢測、生物制劑質量監控

4. 臨床研究：疾病標志物篩查、新生兒遺傳病檢測、激素水平分析

5. 環境與食品安全：痕量污染物檢測、非法添加劑篩查、毒素和過敏原分析

系統支持納升級超高效液相色譜聯用（如Eksigent nanoLC 400系列），耐壓高達10,000 psi，流速范圍0.001-5mL/min，適用于高靈敏度納升流速發現和微升級流速驗證的無縫切換。配合信息依賴采集(IDA)模式，通過高分辨TOF MS預掃描觸發MS/MS，優化碰撞能量誘導碎裂，動態排除干擾離子，匹配快速分離需求。

四、數據管理與分析

TripleTOF 6600配備強大的BioPharmaView和PeakView數據分析軟件，支持：

• 分子特征提取：從海量數據中自動識別化合物峰

• 化學式計算：基于精確質量和同位素比自動推導分子式

• 數據庫檢索：批處理檢索含1600種農獸藥的標準數據庫

• PTM分析：精確定位脫酰胺、氧化、糖基化等翻譯后修飾位點

所有原始數據可儲存供后續深度挖掘，無需重復實驗即可進行新假設驗證。系統提供100%序列覆蓋度的分析能力，如對曲妥珠單抗的全面表征中，單次CESI-MS分析即可獲得重鏈和輕鏈完整氨基酸序列，并鑒定焦谷氨酸環化、蛋氨酸氧化等關鍵修飾。

隨著精準醫學和系統生物學的快速發展，TripleTOF 6600憑借其高通量、高準確性和數據完整性，已成為轉化醫學研究和生物標志物發現的核心工具，持續推動著生命科學研究的邊界拓展和技術革新。